中小企業向け勤怠管理システムおすすめ11選を比較!小規模向けや導入シェアランキングも

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- 中小企業の勤怠管理には業務の属人化や、労働基準法に反するリスクが存在する
- 勤怠管理システムの導入で、リスク回避や人事戦略への活用などもできる
- 気になるシステムは資料請求をして比較検討しよう
中小企業の勤怠管理はどうしてるのだろう…そう考える人事担当の方は少なくありません。本記事では中小企業におすすめの勤怠管理システムをご紹介。中小企業における勤怠管理の課題や、導入シェアの高い人気の勤怠管理システムもランキング形式で紹介します。

目次
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中小企業におすすめの勤怠管理システム11選

勤怠管理ソフトの多くは資料請求をすることで、運用を開始できます。これは公式サイトから検討した場合も同様です。本サイトでは複数のサービスをまとめて比較・資料請求できます。資料請求は無料なので、複数の製品を比較して自社に最適な勤怠管理ソフトを選びましょう。
中小企業向けおすすめ勤怠管理システム
人事労務もカバーする勤怠管理システム7選
人事労務もカバーできる中小企業向け勤怠管理システム一覧表
特徴 | 機能性 | サポート | 無料トライアル | ||
詳細はサービス画像をクリック! | ![]() | 直感的な操作性で 初心者でも簡単に 扱える | ![]() | ![]() | ![]() 30日間 |
![]() | 低コストで人事労務 全体をカバーしたい 企業に | ![]() | ![]() | – | |
![]() | 小規模法人や 中小・大企業まで 幅広い業種に | ![]() | ![]() | ![]() 30日間 | |
![]() | 必要な機能を カスタマイズして 使える | ![]() | ![]() | ![]() 30日間 | |
![]() | 従業員や企業の 就業ルールに 柔軟に対応 | ![]() | ![]() | ![]() 1ヶ月間 | |
![]() | シフト管理や 工数管理にも対応 | ![]() | ![]() | ![]() 30日間 | |
![]() | 交通費精算も まとめて行える | ![]() | ![]() | ![]() 最大2ヶ月間 | |
導入から運用定着までサポート!操作が簡単で使いやすい「ジンジャー勤怠」
jinjer株式会社
ジンジャー勤怠

GOOD
ここがおすすめ!
- 初期設定から定着まで電話・チャット・WEBなどでサポート
- 24時間365日お問い合わせ可能
- スマホアプリ対応で場所を問わず簡単に打刻ができる
- 月末の締め日に見直すだけで簡単に勤怠管理ができる
- 個人だけでなくチーム全体の勤怠管理ができる
MORE
ここが少し気になる…
- スマホアプリだと申請や修正画面がわかりにくい
無駄なコストがかからないシンプルな機能性の「freee勤怠管理Plus」
freee株式会社
freee勤怠管理Plus
GOOD
ここがおすすめ!
- 小規模法人や中小企業向けのシンプルな機能を不自由なく使える
- 1時間1分単位での時間休取得が可能
- GPSの勤怠管理に対応し直行直帰やテレワークでの打刻にも
- 給与計算もできるfreee人事労務と連携することで人事労務全般がカバーできる
MORE
ここが少し気になる…
- 低コストで導入できるが初期設定に手間がかかる
- 連携できるサービスが少ない
正確な勤怠管理の実現と使いやすい操作性「マネーフォワードクラウド勤怠」
株式会社マネーフォワード
マネーフォワードクラウド勤怠
サービスの料金や評判・口コミは
「サービス詳細」をクリック!
GOOD
ここがおすすめ!
- 直感的な操作がしやすく管理側・従業員側ともに使いやすい
- マネーフォワードシリーズを利用している企業は連携が非常に楽
MORE
ここが少し気になる…
- 申請画面がわかりにくい
- メールでの通知機能がなくホーム画面でしかアラートが出ない
企業規模や課題に合わせて機能をカスタマイズできる「ジョブカン勤怠管理」
GOOD
ここがおすすめ!
- プランが豊富で「出勤管理・シフト管理・休暇申請管理・工数管理」の4つの機能から組み合わせて選べるカスタマイズ性の高さ
- 「工数管理機能」を備えており、自社にあった納期の把握と共有の簡素化ができる
- Slack対応で打刻と合わせて始業や就業のタイミングを把握できる
- 医療機関の業種に特化した打刻方法を搭載
MORE
ここが少し気になる…
- 打刻ミスの修正は管理者側で行う必要がある
- シフト変更の管理が難しい
従業員や企業の就業ルールに合わせて柔軟に設定できる「e-就業OasiS」
株式会社ニッポンダイナミックシステムズ
e-就業OasiS

詳しい料金や利用イメージは
「サービス詳細」をClick!
GOOD
ここがおすすめ!
- 環境構築はマスタ設定のみのため、短期間で素早い運用ができる
- 固定勤務・フレックス勤務・時給勤務に対応し、社員ごとに勤務パターンの設定が行える
MORE
ここが少し気になる…
- 英語表示切替機能・プロジェクト工数管理機能はオプション扱いとなる
シフト管理や工数管理にも対応「AKASHI」
GOOD
ここがおすすめ!
- 機能に応じて3種類のプランから選べ、テレワークやシフト・工数管理まで対応している
- 自社にあった就業条件を踏まえて設定してくれる「初期設定サポート」がある
MORE
ここが少し気になる…
- シフトや工程管理まで使いたい場合は400円と割高になる
交通費精算もまとめて行える「キンコン」
GOOD
ここがおすすめ!
- 5名から使えて無料トライアルも60日と長く、機能や使い心地をじっくり検討できる
- CSVやExcel出力だけでなく、サイボウズ社やコラボスタイル社との外部連携も充実
MORE
ここが少し気になる…
- 最低5名の縛りがあり、最大料金の設定もないので人数によっては割高になる
勤怠管理に特化した勤怠管理システム4選
勤怠管理に特化した中小企業向け勤怠管理システム一覧表
特徴 | 機能性 | サポート | 無料トライアル | ||
詳細はサービス画像をクリック! | ![]() | すべての機能を 追加料金なしで 使える | ![]() | ![]() | ![]() 無料デモ |
![]() | 0円から始められる 本格的な勤怠管理 | ![]() | ![]() | ![]() 60日間 | |
![]() | 豊富な打刻方法で 業種や雇用形態を 問わない | ![]() | ![]() | ![]() 30日間 | |
![]() | システム連携で 勤怠業務を効率化 | ![]() | ![]() | ![]() 30日間 |
ワークフローや休暇管理など全ての機能を追加料金なしで使える「レコル」
中央システム株式会社
レコル

GOOD
ここがおすすめ!
- シンプルな価格設定で手軽に導入しやすい
- 誰でも迷わずに使える直感的なUIで初心者でも安心
- 企業のルールやニーズに合った機能が充実している
MORE
ここが少し気になる…
- Google Chrome・Microsoft Edgeの推奨ブラウザでないと、正確に表示されない場合がある
¥0から始めるクラウド勤怠管理システム「スマレジ・タイムカード」
株式会社 スマレジ
スマレジ・タイムカード
GOOD
ここがおすすめ!
- 従業員30名までなら無料で使える
- 無料プランを含む4種類のプランで、自社に合わせて最適なプランを選べる
- 笑顔打刻やGPS機能など豊富な打刻方法
- 他事業所へのヘルプ出勤やシフト外出勤などの臨時の勤怠にも対応
MORE
ここが少し気になる…
- 対応端末がiOSアプリのみでAndroidには対応していない
20種類の多彩な打刻方法で業種や雇用形態を問わない「KING OF TIME」
株式会社ヒューマンテクノロジーズ
KING OF TIME
GOOD
ここがおすすめ!
- 20種類の豊富な打刻方法と5カ国の言語・タイムゾーン対応で就業形態を問わず使える
- シンプルなUIと機能性で従業員への教育コストがかからない
- アラート機能や自動通知機能で労基法違反を防げる
- 残業などの時間外労働や休日勤務の把握がしやすい
- サポート体制やサービスが手厚く、企業や担当者に合わせたサポート体制を作れる
MORE
ここが少し気になる…
- 起動の速さや操作性はPCのスペックに左右される
スマホ対応!従業員30名以下なら無料で使える「HRMOS勤怠 by IEYASU」
IEYASU株式会社
HRMOS勤怠 by IEYASU

詳しい料金プランや利用イメージは
「サービス詳細」をClick!
GOOD
ここがおすすめ!
- 初期費用や月額料金が安く、30名以下であれば無料で使える
- 日々の勤怠管理だけでなく給与明細や賞与なども一括管理できる
- シンプルなUIでわかりやすく複雑な部分がない
- メモ欄があるため、休暇理由やテレワーク勤務など管理者側に伝えやすい
MORE
ここが少し気になる…
- 各種申請後の通知や打刻漏れ等の通知機能がない
- 法改正に対しての機能が少ない
- 有給・休暇関係は一部有料プランになる
【比較表】おすすめの中小企業向け勤怠管理システム
中小企業の勤怠管理の課題

従業員数の少ない中小企業では、従業員の勤怠管理を手書きの勤務表やタイムカードで行う企業も少なくありません。しかし近年では働き方改革の促進や、勤怠管理に関する法改正など、より正確で法令遵守を徹底した勤怠管理が求められています。
また、従業員によって勤務時間が変則的だったり、テレワークの拡大により勤務時間の把握と集計が煩雑になりがちです。アナログな勤怠管理では、給与計算時の転記・計算ミスなどのヒューマンエラーのほか、従業員による不正打刻などの課題も孕んでいます。
中小企業が勤怠管理システムを導入するメリット

従来の課題の解決策としておすすめなのが勤怠管理システムの導入です。中小企業が勤怠管理システムを導入することで、勤怠業務の効率化はもちろんのこと、法改正への迅速な対応や残業超過・長時間労働などの防止に繋がります。
また、勤怠管理システムの中には勤務状況を分析し、グラフで可視化できる製品もあります。分析されたデータから、残業やオーバーワークの多い部署や部門を把握でき、雇用状況の見直しや適切な人員配置に役立ちます。
勤怠管理システムの基礎知識はこちら

わかりやすく解説|勤怠管理システムとは?機能や導入手順・よくある失敗も
勤怠管理システムは、従業員の出退勤の時間や労働時間を適切に管理できるシステムです。給与計算など他システムとも連携でき、業務の効率化や不正打刻の防止にも役立ちます。本記事では、勤怠管理システムの基本機能やメリット・導入方法など詳しく解説します。
中小企業向け勤怠管理システムの選び方
ここでは中小企業が勤怠管理システムを選ぶ際に必要な3つの選び方を紹介します。まずはこのポイントを押さえて自社に最適な勤怠管理システムを検討しましょう。
中小企業が勤怠管理システムを選ぶ際の3つのポイント
従業員の就業形態に対応できるか
専門的な人材を少数精鋭で採用することが多い中小企業では、さまざまな雇用形態で従業員を雇っていることも多いでしょう。例えば、シフト制だったり、フレックスタイム制だったり、それぞれの雇用形態・就業形態に合わせて、細かく勤怠管理を行うのは大変です。
そこで、正社員・契約社員・パートなど、就業形態に対応した勤怠管理システムを導入することで、形態が異なる従業員でも一括で勤怠管理を行うことができます。さらに、GPS機能を使用した、スマホ打刻やICカード打刻などを搭載しているシステムもあります。
よって、勤怠管理システムを選ぶ際には、こういった従業員の雇用形態・就業形態に柔軟に対応できるシステムを選びましょう。
ワークフロー機能を搭載しているか
勤怠管理には期間限定の就業方法があります。例えば、夏季休暇や有給休暇、残業申請などが含まれます。そういった勤務方法に関して、社内で独自の承認フローを要している企業も少なくありません。
そこで、近年のテレワーク化にも対応したワークフロー機能を搭載する勤怠管理システムを選ぶことで、大幅な承認フローの削減が可能となります。社外でも、スマートフォンから申請・承認業務を行いたい企業は、このワークフローツールも検討のポイントとしましょう。
給与システムなどと連携できるか
現在、社内で給与システムや労務管理システムを使用している場合、それらと連携可能な勤怠管理システムを選ぶことが重要です。なぜなら、今まで手作業で情報を転記していたものが、システムの連携によって不要になり、さらなる業務の効率化につながるからです。
なお、連携方法に関しては、専用のアプリをダウンロードしたり、CSVファイルを使用したりする場合があるため、導入前にシステム同士の連携方法に関しても十分に確認するようにしてください。
勤怠管理システムの詳しい選び方はこちら

おすすめ勤怠管理システム10選(全48選)を徹底比較|中小企業向けや無料で使える製品も
従業員の出退勤時間を自動集計し、労働時間の管理や給与計算に役立つ勤怠管理システム。本記事ではおすすめの勤怠管理システムを選び方とともに紹介します。小規模法人や中小企業向け・無料で使える製品など比較一覧表で紹介するので、ぜひ参考にしてください。
業界シェアが高い勤怠管理システム人気ランキングTOP3

ここでは、株式会社PIGNUSが行った調査結果*を元に、業界シェアの高い勤怠管理システムをランキング形式で紹介します。勤怠管理システムを検討する際に、ぜひ役立ててください。
※株式会社PIGNUS「クラウド勤怠管理システム市場シェア調査」
1位:ジンジャー勤怠
jinjer株式会社
ジンジャー勤怠

GOOD
ここがおすすめ!
- 初期設定から定着まで電話・チャット・WEBなどでサポート
- 24時間365日お問い合わせ可能
- スマホアプリ対応で場所を問わず簡単に打刻ができる
- 月末の締め日に見直すだけで簡単に勤怠管理ができる
- 個人だけでなくチーム全体の勤怠管理ができる
MORE
ここが少し気になる…
- スマホアプリだと申請や修正画面がわかりにくい
ジンジャー勤怠はシンプルなUIと画面表示で誰でも簡単に勤怠管理が行えます。勤務実績や申請等を一覧で確認できるため、従業員の未打刻や遅刻・早退・申請の承認漏れに対して迅速に対応できます。
株式会社PIGNUSの調査によると、勤怠管理システムを導入している企業の9.8%はジンジャー勤怠を利用しています。個人事業主や中小企業・大企業の利用率も高く、企業規模を問わず幅広く利用できる人気の勤怠管理システムです。
資料請求はこちらから
![]() | シリーズ累計登録社数 18,000社!
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2位:ジョブカン勤怠管理
GOOD
ここがおすすめ!
- プランが豊富で「出勤管理・シフト管理・休暇申請管理・工数管理」の4つの機能から組み合わせて選べるカスタマイズ性の高さ
- 「工数管理機能」を備えており、自社にあった納期の把握と共有の簡素化ができる
- Slack対応で打刻と合わせて始業や就業のタイミングを把握できる
- 医療機関の業種に特化した打刻方法を搭載
MORE
ここが少し気になる…
- 打刻ミスの修正は管理者側で行う必要がある
- シフト変更の管理が難しい
ジョブカン勤怠管理システムは、シリーズ累計導入実績25万社を超える勤怠管理システムです。出勤管理やシフト管理など4つの機能から自由にカスタマイズして利用できるほか、無料プランも提供しているので、企業規模や勤務形態を問わず利用できます。
株式会社PIGNUSの調査によると、勤怠管理システムを導入している企業の9.5%はジョブカン勤怠管理を利用しています。中でも中堅企業の利用率が高く、シリーズ連携やSlack連携など豊富な連携機能でバックオフィス全体をサポートできるため、法人向けの勤怠管理システムとして特におすすめです。
3位:TimeProシリーズ

詳しい料金プランや利用イメージは
「サービス詳細」をClick!
GOOD
ここがおすすめ!
- クラウド型とオンプレミス型対応で企業のニーズに合わせて柔軟に導入できる
- TOP画面で必要な情報とやるべき業務が把握でき直感的な操作に繋がる
- 専門SEによる導入サポートでストレスフリーな運用へ
MORE
ここが少し気になる…
- 有給休暇申請など申請機能のメニューがわかりにくい
- UIが気になるなどの口コミも
「TimePro-VG」や「CYBER XEED」など複数の勤怠管理システムを展開するTimeProシリーズは、企業規模や費用に合わせて複数のラインナップから選択できるのが特徴です。
株式会社PIGNUSの調査によると、勤怠管理システムを導入している企業の8.3%はTimeProシリーズを利用しています。TimeProシリーズは特に大企業や中堅企業など法人での利用率が高く、正社員やパート・アルバイトなどの雇用形態や、変形労働時間制・フレックス勤務などの複雑な就業管理にも対応しています。
中小企業向け勤怠管理システム9選を見る業界シェアが高い勤怠管理システム比較一覧表
その他のおすすめ勤怠管理システム

ここでは記事冒頭では紹介しきれなかった、おすすめの勤怠管理システムを紹介します。
株式会社庚伸
Dr.オフィスLookJOB2


GOOD
ここがおすすめ!
- 登録人数無制限の定額制勤怠管理システム
- 退社した従業員のアカウントも削除する必要がなく、永久に保持できる
- 雇用形態や従業員数が多い飲食店や、従業員の入れ替わりが多い医療・介護業界にもおすすめ
- 導入時や導入後のサポートが丁寧
- 「奉行シリーズ(OBC)」との連携が可能
MORE
ここが少し気になる…
- 導入後1年間は途中解約ができない
- マニュアルやQ&Aが充実しておらず担当者への問い合わせが必要になる
株式会社ネオレックス
キンタイミライ(旧:バイバイタイムカード)

株式会社Works Human Intelligence
COMPANY 勤怠管理システム

まとめ
中小企業は、大企業と違い従業員が少ないため、勤怠管理はソフトへの手入力などで行われていることが多いですが、作業効率の悪さや、正確性を求められる担当者の業務負担の多さなどの課題があります。さらに、法改正が生じた場合も、対応に時間がかかるでしょう。
そこで、勤怠管理システムを導入することで、管理の一括化や迅速なアップデートによる法改正が行えます。その結果、作業効率が大幅に上がることで従業員の満足度も向上し、勤怠データを活用すれば、人員配置の見直しができるメリットもあります。
中小企業が勤怠に関する業務を効率化したい場合は、勤怠管理システムを導入し、効率よく正確な労働時間を把握して、従業員の満足度を高めていきましょう。
勤怠管理をさらに効率化!関連サービスはこちら
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